ابتدا دانشجو باید حیطه پایان نامه خود را مشخص کند. به طور معمول، این موضوع به علاقه شخصی دانشجو باز میگردد. سپس دانشجو در همان حيطه، استاد راهنماي مورد علاقه خود را انتخاب و براي تعيين موضوع مناسب براي با وي مشورت مينمايد. اساتيد راهنما با در نظر گرفتن مقطع تحصيلي دانشجو و معيارهاي آموزشي و پژوهشي لازم، در انتخاب موضوع پايان نامه به دانشجو کمک ميکنند. بررسی محتوای پروپوزال شامل تازگی موضوع، انطباق موضوع انتخاب شده با اولویتهای ملی و استاني، درستي و کامل بودن مقدمه و ضرورت اجرا و مرور متون، درستي و کامل بودن روش اجرا، ملاحظات اخلاقي پژوهش، ميزان مشارکت دانشجو در فعاليتهاي اجرايي پايان نامه، دستاوردهاي حاصل از اجراي پژوهش مانند انتشار مقاله يا ارائه محصول يا فناوري.